건강보험심사평가원이 건강보험 보장성 강화 등 정부정책 업무 수행 관련 인원이 대폭 증가함에 따라 1사옥 규모로는 수용이 도저히 불가하다는 판단 아래 복지부 등 행정청과 협의한 결과, 추가로 2사옥 건립을 추진한다. 

1사옥은 1,145명을 수용토록 설계하여 2015년 12월에 이전 완료했으나, 2017년 8월 기준 183명이 증가한 1,328명이 현재 1사옥에서 근무하고 있다.

2사옥 부지 면적은 38,398㎡이며 1인당 연면적은 40.56㎡로 타 공공기관(평균41.1㎡)에 비해 좁게 계획됐다. 1,294명을 수용토록 설계됐고, 건립 예산은 1,514억 원(대지 211억 원 포함)이다. 이전시기는 2019년 12월 계획이다.

심평원 신사옥건립팀 김창호 팀장은 "2사옥 이전시기는 당초 2019년 12월로 계획했으나, 국토부에서 시공시점 계획변경 조건으로 2018년 12월 승인한 바 있다. 현재 2사옥은 2017년 11월 20일 착공 시 물리적으로 2018년 12월까지 완공이 어려운 상황이다. 따라서, 복지부, 국토부에 사전설명을 통해 2019년 12월에 이전계획변경 협의가 완료된 상태이다."라고 말했다. 

2사옥 추진 경과를 살펴보면, 2015년 6월 단계별 지방이전 계획에 따라 국토부와 복지부로부터 승인을 받았고, 2015년 12월 건립부지를 211억원에 매입했으며, 2016년 1월 조달청 맞춤형서비스 약정을 체결했다.

2016년 3월 2사옥 건립 기본계획을 수립해 설계지침서 및 과업내용 등을 작성했으며, 2016년 11월부터 CM단이 선정돼 본 사업을 착수했다. 올해 5월에는 원주시청으로부터 건축 인허가를 완료하고, 설계도서가 2017년 6월에 완료됨에 따라 11월 중 안전관리계획에서 심의 완료되면 11월 20일 착공예정이다.

김창호 팀장은 "2사옥 착공은 현재 11월 20일로 예정되어 있다. 착공식은 생략할 예정이며, 착공식 비용은 생활필수품 등을 구입하여 원주시와 협의해 지역사회의 어려운 곳에 기부할 예정이다."라면서, "2사옥 준공은 17년 11월 20일 착공을 시작으로 공사기간 690일이 소요되며 2019년 10월 10일 준공을 목표로 공사가 진행될 예정이다. 따라서 준공 후 2019년 12월까지 시운전을 거쳐 지방이전 완료할 예정이다."라고 말했다.