한국의학교육평가원 이사회는 이사장의 임기만료에 따라 2016년 3월 24일(목) 제18차 이사회를 개최하고 제5기 이사장으로 김봉옥 충남대학교병원장을 선출했다. 임기는 3년으로 2016년 3월부터 2019년 2월까지이다.

의학교육평가원 임원진은 제1기(2004~2007년) 김세곤 이사장, 이종욱 원장, 제2기(2007~2010년) 김성덕 이사장, 이무상 원장, 제3기(2010~2013년), 제4기(2013~2016년) 이윤성 이사장, 안덕선 원장이 역임했다. 제5기 원장은 2016년 2월25일(목) 제17차 이사회에서 김영창 원장을 선임한 바 있다.

김봉옥 이사장은 대한의사협회 부회장 및 국제협력위원회 위원, 대한병원협회 국제이사, 한국여자의사회 부회장(차기 회장), 국제키비탄 한국본부 한밭클럽 회장, 한국보건복지인력개발원 비상임이사 등 의료계 여러 분야의 직책을 수행하고 있다.